Una menor de edad sí puede pedir que se le practique un aborto, siempre que se encuentre amparada por alguna de las tres causales que contempla el artículo 119 del Código Sanitario. Entre las mujeres menores de dieciocho años, este artículo distingue entre las mayores y menores de catorce, para señalar cómo deben prestar su consentimiento.

En el caso de que la mujer que solicita un aborto tenga menos de catorce años, además de su consentimiento, requiere de la autorización de su representante legal y, en caso de contar con más de uno, de solamente uno de ellos, a elección de la niña. Ahora bien, si el o los representantes legales se niegan o no son habidos, la niña tiene que solicitar al juez que constate la existencia de la causal, asistida por un integrante del equipo de salud. Una vez presentada la solicitud, el tribunal tiene 48 horas para resolver, verbalmente y sin forma de juicio, con los antecedentes que le proporcione el equipo de salud y oyendo tanto a la niña como al representante legal, en caso de que éste haya denegado su autorización. Además, si lo considera procedente, puede oír también a un integrante del equipo de salud que le asista.

Ahora bien, en el caso anterior, si en opinión del médico existen antecedentes para estimar que la autorización del representante legal de la menor puede traer consecuencias perniciosas para la integridad de esta, tales como maltrato psíquico o físico, abandono, entre otras que detalla la ley, puede solicitar una autorización judicial sustitutiva. Para ello el médico debe dejar constancia de su opinión por escrito. En este caso, el procedimiento para pedir la autorización sustitutiva es reservado y solamente se admitirá la oposición del representante legal que hubiera denegado la autorización. Esta resolución es apelable.